Судебная экологическая экспертиза (СЭЭ) классифицируется приказом Минюста следующим образом:

• Исследование экологического состояния объектов почвенно-геологического происхождения
• Исследование экологического состояния естественных и искусственных биоценозов
• Исследование радиационной обстановки.

Это слишком общая классификация. На самом деле СЭЭ охватывает очень много объектов:

• экспертиза катастроф
• экспертиза шумов и шумового фона
• экспертиза вибрации
• экспертиза электромагнитного излучения
• экспертиза радиации и радиационного фона
• экспертиза воды
• экспертиза почв (является также объектом почвоведческой экспертизы)
• экспертиза воздуха
• экспертиза объектов животного и растительного мира (является также объектом биологической экспертизы).

Целями и задачами проведения СЭЭ являются:

• экспертная оценка нанесённого окружающей среде вреда 
• определение размеров материального ущерба
• обоснование заявленных территориальными природоохранными органами сумм материального ущерба
• обоснование сумм, предназначенных на возмещение вреда, нанесённого здоровью человека и другие.